分かるわけではないのですが、「アクロニス」とは「Acronis True Image(以下「ATI」)」でしょうか？もしそうだとしたら、そのバージョンは？
それと、C:かD:のサイズを変更しましたか？

以前HDDの引っ越しをしたときに、「ATI 8.0」では、restoreの際にXp SP2のシステムドライブのサイズを変更すると、全く同じ症状で起動できませんでした。当然バックアップ元も書き込み先もベーシックディスクです。
色々試した結果、変更すると起動しなかったのはシステムドライブ（その時はシングルブートなのでDrive C:）のサイズだけで、それ以外のドライブのサイズ等を変更しても何も問題はありませんでした。試していないので推測ですが、先頭セクタの位置を動かしてもダメかもしれません。

それ以降のバージョン（少なくともATI 11 Homeはダメでした）、ATI以外のユーティリティ、Xp SP2、SP3以外のOSでは試していないので、どうなるのかは分かりません。

レス有難うございます。

　バージョンは初期のものです。ご指摘いただいたとおり、パーテイションサイズを動かすと全て起動できなくなりますね。実はそれで一度失敗しています。

なので、今回はパーテイションサイズは変えずにコピーしました。（未使用の領域が余っていますが…。）

　解せないのは、２０００、ビスタは立ち上がるのに、XPだけがリブートを繰り返す、と言う点です。
　他のHDDを買い、コピーをすれば当該のHDDが何らかの不良？かと思うのですが、検証しようにも元の300GBが立ち上がらなくなり、クローンの500GBしかないのです。

元のXPにインストールしたアクロニスでバックアップした、と言う事が影響しているのでしょうか？


　構想としてはクローンの500GBを正常化し、近いうちにバックアップHDDをもう一台用意し、今の状態で
クロ−ンを作成しておこうと思うのですが…。
　
　Xpを再インストールすると、恐らく２０００とビスタが立ち上がらなくなると思うのですが、
再インストールの際は


　まず２０００で立ち上げ、

2000のNTLDR
　　　NTDETECT.COM　
　　　BOOTFONT.BIN　
　　　NTBOOTDD.SYS
をコピー。XPを再インストールしXPから立ち上げ、２０００のドライブにアクセスし、2000のコピーしたデータを戻せば、マルチブートが復活？と思うのですが、この認識で間違いないのでしょうか？

　再インストールする場合、

　２０００でXpの領域を消去してからインストールした方が良いのでしょうか？
Xpのインストール時の領域の開放、フォーマットで良いのでしょうか？

　ちなみにブート画面はビスタのブート画面→古いバージョンのWindows→２０００、XP選択となっています。


　大分以前に同じような事をして、単純にXPをインストールしたら全て立ち上がらなくなり、結局全て再インストールした経験があるのですが、流石にそれ以降、バージョンアップを繰り返している今の状況を一から再構築するのは骨が折れますので…最悪はそれしかないと思っていますが。


　9821時代、Win95　Win98　は丸ごとバックアップ→起動なんて、簡単に出来たものですが…。

後半部については、Vistaが絡んだ状態での経験がないので、分かりません。m(_ _)m

前半部については、こんなものが見つかりました。

クローン機能でディスク全体をコピーしたら、システムが起動しません
ttp://www.runexy.co.jp/support/faq/faq_acronis_consumer/detail/faq_0006236/

クローンまたは復元後に STOP: 0x0000007B エラーで起動できない
ttp://www.runexy.co.jp/support/faq/faq_acronis_consumer/detail/faq_0006400

これを併せて考えると、
2000はUDMA5、UDMA6関係なくしかも1stパーティションなので問題なし
Xpはジオメトリ又はドライバの関係でNG
Vistaはドライバを自前で持っていて、ジオメトリ変化にも対応できる？
ということなのでしょうか。
クローンでなく一旦バックアップをとって書き戻すか、あるいは500GB HDDの動作モードを300GB HDDと同じにして見るということでしょうか……

元の300GB HDDが失われているとのことですので、500GB HDDを書き換える前に、バックアップも残る方法で取り敢えず試してみるというのはいかがでしょう。

お力になれなくて済みません。

True Image 9.0で同様にクローンを使ったコピーをしようとしたところ、ファイルシステムをぶっ壊された経験があります。
現在ダウンロードできるビルド3884では直っているようです。
http://www.runexy.co.jp/support/updater/acronis_trueimage_9/

# 起動しないのがXPなので関係ないでしょうが、VistaからBCDに変わって、対応していないコピーツールだと正しくコピーできなくなってしまうというのもありますね。