タイムスタンプとかファイルサイズとかいろんな条件設定できる
コピーツールといえば拡張コピーというものがありますが
LinkStationできちんとできるかどうかはわかりませんねぇ

これが使えそうですが、どうでしょうか。

K.TakataさんのK.Takata's Web Page
ttp://webs.to/ken/
K.Takata's software > ハードウェア > kuroclk Ver.0.00

ファイルシステムによって、タイムスタンプの持ち方が違うので（例えばNTFSでは100ナノ秒単位、FATでは偶数秒単位）、丸め込みによってタイムスタンプを同一と見なしてくれないのが原因かも知れないですね。

Jokerさんお書きの拡張コピーでは、「XXXミリ秒以内は同一と見なす」という設定ができるので、自分も重宝しています。
（自分もよく、NTFSなHD → FATなMOへのバックアップで同じようなことが起こっていました）

あと、ググったところ、以下のようなソフトも見つけました。
http://www.forest.impress.co.jp/article/2004/03/03/mfsync.html

Jokerさん、よねよねさんお書きの、拡張コピーで出来ました。
原因は、よねよねさんお書きの通り、タイムスタンプの持ち方の違いだったようです。
NTFSのＰＣ側が０．００１秒単位で、LinkStationは偶数秒単位のようです。
同じファイルなのに、タイムスタンプに１．１０９秒の差が生じていました。
その為、別のタイムスタンプと見なして、コピーしていたようです。
拡張コピーの設定でも、「XXXミリ秒以内は同一と見なす」がデフォルトで1000なのですが、2000程度にしないと、上記のようなファイルがコピーされてしまいます。

あとは、忘れていても、ある時間に自動的に動作してくれると嬉しいのですが。

なるほど、LinkStationは駄目で、USB2の単独外付けHDD(FAT32)はＯＫな理由が判りました。
NTFSからコピーした際の、タイムスタンプの丸め方の違いのようですね。
たとえば、6:52:49.109 というタイムスタンプを、LinkStationは、6:52:48にしてしまい、USB2外付は 6:52:50 にしたようです。
USB2外付の場合、タイムスタンプが違っていても、ほんのコンマ数秒なれど、新しいファイルと見なしてコピーしないのですね。

なるほどー。
FATへのコピー時は切り上げを行いますので（0秒001〜2秒000 → 2秒000）、新しいと判断されるわけですね。
（FAT → NTFSへのコピーだったら、逆の結果になっていたわけでしょうね）

どうも、ありがとうございました。
とりあえず、XCOPYで、問題回避策が見つかりました。

ＰＣのデータをバックアップするのに、LinkStationとUSB2の外付けHDDにコピーしようと思っていたので。
当初は、ＰＣからそれぞれにXCOPYかけていたのですが、まずPCからUSB2の外付けにコピーし、USB2の外付けからLinkStationにコピーすれば良いみたいです。

見当違いのレスで、申し訳ありませんでした。

既に解決しているようですが、こちらのバックアップソフトでコマンドラインを指定すると、タスクスケジューラで自動化できると思います。
ttp://www2.biglobe.ne.jp/~sota/ の Backup です。

湯葉さん、ありがとうございます。
有名なFFFTPの作者さん、バックアップのソフトも作られているのですね。

XCOPYでの回避策が見つかりましたので、しばらくは、XCOPY+タスクで、自動バックアップするように使ってみます。

1/1000秒単位までタイムスタンプのNTFSから、複数秒単位のFAT32にファイルをコピーした場合、LinkStationは切捨て、USB2の外付けHDDは切上げ、するようで。
切り上げれば、バックアップ先のファイルの方が新しいのでコピーしない。
切り捨てられた場合、バックアップ先のファイルが古くなるので、コピーしてしまう。
という動作だったようですね。

LinkStation側のファームウェアをアップデートして、タイムスタンプ切り上げ処理してくれれば、解決するのですけどね。