fmlの設定をしたことがないので、まったくの想像なのですが．．．
そもそもヘッダ部分の日本語は Base64エンコードされますので、「=?iso-2022-jp?B?gseC6YKxgt4=?=」とエンコードしたものを直接記述するのはどうでしょう？
（ちなみに、「gseC6YKxgt4=」が「どるこむ」をエンコードしたものです。）

と思ってやったんですが
[?ISO-2022-JP?B?GyRCQy5MIw5OVQKEI6IA==?=]
とそのまま帰ってきましたデコードしちゃだめですよw

あらら．．．

おや？自分もメーラによって挙動が異なりますね。
UNIXの mailコマンド使って「From: =?iso-2022-jp?B?gseC6YKxgt4=?=」で送ってみた結果ですが、Becky!だと「From: どるこむ」、某Webメールだと「From: =?iso-2022-jp?B?gseC6YKxgt4=?=」でした。

申し訳ないです．．．

# ちなみに、先頭に「=」は入っていますよね？

>先頭に「=」は

あれ、どうやったやろ
確認してみます